Nadzemní plodnice, za nimiž se vydávají do lesů houbaři, představují jen zlomek organismu hub. Jeho podstatná část se ukrývá pod zemí v podobě husté sítě houbových vláken. Ta bývají napojená na kořeny rostlin, s kterými žije houba v symbióze. Rostlina poskytuje houbě energeticky bohaté živiny a na oplátku od ní získává vodu s rozpuštěnými minerály.
Houbová vlákna sehrávají i roli prostředníků mezi rostlinami. Vzrostlé stromy přes ně posílají živiny drobným semenáčkům, které by ve stínu lesních velikánů bez této potravinové pomoci těžko přežily. Prostřednictvím hub si pomáhají dokonce i zástupci flóry různých druhů.